Двумерная инфракрасная спектроскопия
Использование современных физических инструментов в области биологии и медицины является одним из доминирующих трендов развития науки и сопутствующих технологий. Оптические методы в настоящее время широко используется для исследования структуры сложных химических и биологических соединений, в частности, белков. Спектроскопия поглощения и комбинационного рассеяния, Фурье- спектроскопия, а также целый спектр нелинейно-оптических методов обеспечивают высокую информативность, пространственное и временное разрешение. Одним из новых методов, помогающих получить ответы на вопросы о динамике и конформационных изменениях в сложных молекулярных соединениях и ангармонизме колебаний является двумерная импульсная инфракрасная спектроскопия. Этот метод по сути является одним из нелинейно-оптических методов, реализуемых за счет резонансного четырехволнового взаимодействия предельно коротких лазерных импульсов среднего инфракрасного диапазона с молекулярными переходами исследуемых объектов. Эта методика является информативной, но в тоже время очень сложной, требующей наличия уникальной лазерной и измерительной техники, работающей в среднем инфракрасном спектре. Это условие является принципиально важным, так как в этом диапазоне располагается значительная часть практически значимых колебательных и вращательных резонансов биологическим молекул. Техника двумерной ИК-спектросокпии активно развивается в различных зарубежных университетах и научных центрах, однако, в России практически не используется, в том числе в связи с необходимостью использования сложной и дорогостоящей экспериментальной техники. Наша научная группа обладает необходимым базовым экспериментальным оборудованием и богатым опытом реализации нелинейно-оптических методов, и стремится развивать и использовать метод двумерной инфракрасной ИК спектроскопии для структурной диагностики сложных органических соединений. В первую очередь объектом исследований могут быть белковые структуры, составляющие основу опто- и термочувствительные каналов, а также новые типы маркерных и флуоресцентных белков, используемых в нейрофотонике, опто- и термогенетике.
Двумерная ИК спектроскопия является относительно новым и эффективным методом нелинейно-оптической спектроскопии, обеспечивающим получение большего объема спектральной информации относительно стандартных методик инфракрасной спектроскопии. Это преимущество реализуется за счет варьирования и регистрации по нескольким спектрально-временным переменным и в результате дает информацию о связи колебательных мод, ангармонизме колебаний, динамике конформационных изменений в сложных молекулах с фемтосекундным временным разрешением. Можно сказать, что методы двумерной и многомерной ИК-спектроскопия являются развитием методов спектроскопии ядерного магнитного резонанса (ЯМР-спектроскопии). Однако, в ЯМР-спектроскопии временное разрешение составляет величины порядка миллисекунд и более, поэтому даже твердотельную ЯМР-спектроскопию трудно применить к динамическим системам. Совмещение высокого временного разрешения и спектральной чувствительности к структурным характеристикам делают двумерную инфракрасную спектроскопию чрезвычайно мощным экспериментальным инструментом.
Можно сказать, что любое спектроскопическое измерение, которое изображается как функция двух переменных, в некотором смысле является двумерным спектром, однако, в настоящее время термин «двумерная спектроскопия» применяется к ситуации, реализуемой именно в следующей интерпретации. На исследуемый образец падают три импульса A, B и C и генерируют сигнал S. Импульсы разнесены во времени с задержками t1 и t2, а сигнал излучается во времени t3. Первый импульс с волновым вектором kA переводит систему в когерентную суперпозицию между основным состоянием |0> и возбужденным состоянием |1>. Второй импульс kB преобразует суперпозицию в совокупность возбужденных состояний. Населенность в возбужденном состоянии не колеблется, но сохраняет фазу состояния суперпозиции. Третий импульс kC преобразует населенность обратно в состояние когерентной суперпозиции, которое излучает поле сигнала с волновым вектором kS = — kA + kB + kC. Двумерный спектр затем генерируется путем сканирования времени t1 и записи сигнала как функции времени t3, а далее реализуется в процессе двумерного преобразования Фурье относительно времен t1 и t3 [1]. Очевидно, что форма и свойства генерирующегося импульса S зависят от падающих на образец импульсов A, B и C, их пространственного и временного распределения, и от оптических свойств среды.
Рис. 1. Порядок следования импульсов и изменение энергетического состояния в двухуровневой системе в результате их действия [1].
Большинство спектроскопических, в том числе нелинейных, методик третьего порядка не полностью измеряют функции отклика, обнуляя некоторые из переменных времени t1, t2 или t3, интегрируя их и/или измеряя только модуль комплексной функции отклика. Двумерная ИК-спектроскопия, напротив, способна измерить функции отклика третьего порядка во всей их полноте, используя последовательность коротких импульсов, которые минимизируют свертки в уравнении для описания поляризации среды, что приводит к возможности регистрации как амплитудных, так фазовых компонент. Можно сказать, что двумерная ИК-спектроскопия извлекает максимальное количество информации об изучаемой молекулярной системе [2]. Например, в одномерном спектре невозможно различить связанные и несвязанные резонансы. Напротив, в двумерном спектре связанные резонансы приводят к формированию недиагональных перекрестных пиков с частотой поглощения одного резонанса и частотой излучения другого, тогда как несвязанные резонансы проявляются на двумерном спектре вдоль диагональной линии. На рисунке приведены одномерный и двумерный спектры двух линий паров калия. Линии соответствуют переходам из основного состояния в два различных возбужденных состояния и поэтому резонансы связаны между собой. В результате 2D-спектр показывает четыре пика. Два пика, обозначенные A и B, лежат на диагонали и соответствуют переходам D1 и D2. Пики C и D представляют собой недиагональные перекрестные пики с частотой поглощения одного перехода и частотой излучения другого, как и ожидается для связанных резонансов.
Одномерный спектр поглощения (a), двумерный спектр (b) и соответствующие уровни энергии (c) паров калия [1].
Двумерная спектроскопия является технически сложной методикой, для её реализации необходимы точный контроль временных задержек между импульсами и определенное пространственное распределение пучков накачки для выполнения фазового синхронизма [3, 4]. Однако, все это помогает реализовать мощнейший инструмент для исследования молекулярной структуры и динамики сложных белковых комплексов на фемтосекундном масштабе времени с высоким спектральным разрешением. Дополнительная информация, а также гибкость во временном и поляризационном управлении лазерными импульсами, способствует идентификации и интерпретации спектральных линий, что особенно важно при изучении комплексов молекул. В последние годы разработано большое количество разнообразных улучшений метода многомерной инфракрасной спектроскопии. Так, полезным оказывается измерение двумерных спектров с одновременным нестационарным воздействием различной природы на исследуемый объект: скачок температуры, лазерная ионизация, быстрое смешивание, начало химической реакции и т.п. Многомерные эксперименты с использованием одновременно ИК и видимого излучения очень важны для изучения эффектов фотосинтеза.
Схема для двумерной ИК спектроскопии (лаб. 508 МГУ).
В лаборатории 508 МГУ имеется источник сверхкоротких импульсов среднего инфракрасного диапазона с микроджоулевыми уровнями энергий, что позволяет получить последовательность нескольких фемтосекундных импульсов, необходимых для реализации схемы двумерной инфракрасной спектроскопии. Этот источник включает в себя генератор фемтосекундных импульсов на кристалле Ti:Sapphire, регенеративный усилитель и две последовательные ступени понижения частоты (подробности см. в разделе Лаборатории и оборудование). Фемтосекундные импульсы среднего ИК диапазона далее используются в оптической схеме, представленной на рисунке. Для контроля временных задержек между импульсами используется две интерферометрические и квадратурное детектирование.
Для теоретического моделирования двумерной ИК спектроскопии будет использоваться квантовое описание процесса взаимодействия полей накачки с исследуемой средой с использованием формализма матрицы плотности и анализом ее эволюции (и, соответственно, анализа динамического отклика вещества) на основе решения уравнения фон Неймана для матрицы плотности в приближении теории возмущений с учетом марковости релаксационных процессов. В настоящее время проведено тестирование численного кода на примере модельной системы — молекулы воды. При построении двумерных спектров восстанавливается ангармонизм колебаний в трехуровневой системе, что подтверждает корректность работы кода и возможность его применения для теоретического исследования отклика сложных молекулярных соединений и их динамики.
Пример рассчитанной двумерной спектрограммы молекулы воды для двух задержек зондирующего импульса.
Развиваемая методика нелинейной спектроскопия будет использована для структурной диагностики полупроводниковых наночастиц, сложных органических соединений и биомолекул. Методы двумерной ИК-спектроскопии помогут исследовать пространственно-энергетическое устройство молекул, охарактеризовать первичную и вторичную структуру белков в динамике, и позволят разобраться в процессах, отвечающих за конформационные изменения в белковых структурах, в частности, термо- и фотоактивацию мембранных белков.
- S. T. Cundiff and S. Mukamel, «Optical multidimensional coherent spectroscopy,» Phys. Today 66, 44–49 (2013).
- P. Hamm and M. Zanni, Concepts and Methods of 2D Infrared Spectroscopy (Cambridge University Press, 2011).
- X. Dai, A. D. Bristow, D. Karaiskaj, and S. T. Cundiff, «Two-dimensional Fourier-transform spectroscopy of potassium vapor,» Physical Review A 82, 052503 (2010).
- T. Buckup and J. Léonard, Multidimensional Time-Resolved Spectroscopy (Springer, 2018).
- D. R. Skoff, J. E. Laaser, S. S. Mukherjee, C. T. Middleton, and M. T. Zanni, «Simplified and economical 2D IR spectrometer design using a dual acousto-optic modulator,» Chemical physics 422, 8–15 (2013).